Claude спроектировал белковые биндеры к нейротоксинам скорпионов

Исследовательская модель Anthropic сгенерировала 318 484 варианта мини-белков, способных связываться с нейротоксинами скорпионов. Из 211 лабораторно проверенных конструкций 17 прошли заданные критерии, однако их способность нейтрализовать яд пока не подтверждена.

Anthropic применила исследовательскую модель Claude для проектирования с нуля белковых биндеров — небольших молекул, связывающихся с заданной биологической мишенью. Целью стали пять опасных для человека нейротоксинов четырех видов скорпионов.

Модель работала в среде Claude Science и использовала 12 инструментов для проектирования и оценки белков. За 64 часа она создала 318 484 варианта и отобрала 180 кандидатов; исследователи с помощью Claude добавили еще 31. Партнеры Anthropic из Adaptyv Bio и Twist Bioscience проверили конструкции экспериментально, и 17 из них удовлетворили критериям связывания.

Все успешные конструкции связывались только с одним токсином: семь — с Cn2, по четыре — с AaH I и AaH II, две — с LqhIII. Создать биндер, прошедший критерии сразу для нескольких токсинов, не удалось.

Две наиболее сильные конструкции, Cn2-B1 и Cn2-B2, связывались с мексиканским токсином Cn2 с однозначной наномолярной аффинностью. Эксперименты указывают, что они воздействуют на тот же или соседний участок токсина, что и антитело, способное нейтрализовать Cn2 у мышей.

Пока проверено только связывание с рекомбинантными токсинами. Испытаний на клетках и животных не проводилось, поэтому считать полученные белки противоядием нельзя. Anthropic опубликовала все 211 конструкций, их предсказанные структуры и экспериментальные данные для дальнейших исследований.