Anthropic: агенты Claude обнаружили ранее неописанную ферментную систему у бактериофагов

Anthropic сообщила, что система примерно из 950 агентов Claude за 21 час анализа ДНК-последовательностей выявила у бактериофагов ранее неописанную систему на основе обратной транскриптазы. Ее организация напоминает массивы CRISPR, однако функция находки пока не установлена, а результаты опубликованы как препринт.

Anthropic, разработчик ИИ-моделей Claude, представила первые результаты работы собственной биологической лаборатории. Компания поручила агентам Claude искать необычные обратные транскриптазы — ферменты, копирующие РНК в ДНК, — в крупной базе генетических последовательностей.

Около 950 агентов за 21 час использовали 210 млн токенов, собрали сведения более чем о 200 тыс. обратных транскриптазах и выделили 3500 систем-кандидатов. Один из агентов обнаружил рядом с геном необычного фермента массив равномерно расположенных повторов ДНК. После проверки и лабораторных экспериментов исследователи назвали систему ART — array-associated reverse transcriptases, или обратные транскриптазы, связанные с массивами повторов.

ART встречается преимущественно у бактериофагов — вирусов, заражающих бактерии, — и включает обратную транскриптазу, соседний вспомогательный ген и длинный массив повторов ДНК. По данным Anthropic, этот массив экспрессируется в виде набора коротких РНК, что отчасти напоминает устройство программируемых систем CRISPR.

Сама обратная транскриптаза была известна ранее; предполагаемая новизна состоит в выявлении связанного с ней массива повторов и дополнительного белка. Функция ART пока неизвестна, поэтому сравнение с CRISPR относится только к отдельным структурным признакам и не означает, что система пригодна для редактирования генов. Вычислительный поиск выполняли агенты Claude, но кандидата оценивали специалисты, а все физические эксперименты проводили люди. Подробности опубликованы в препринте Anthropic.